Pepernoten worden al eeuwenlang gebakken, maar waren oorspronkelijk een vrij exclusieve traktatie. De specerijen die hiervoor werden gebruikt, zoals peper en honing, waren namelijk heel duur. Dankzij de Verenigde Oost-Indische Compagnie (VOC) werden vanaf de zeventiende eeuw specerijen als peper, nootmuskaat, kaneel, gember en kruidnagels steeds normaler in Nederland. In die periode ontstonden ook de speculaaskruiden en dus ook de kruidnootjes. Sinds de negentiende eeuw staan er recepten voor kruidnoten in receptenboeken.